بخش دوم این کتاب، نمایه‌ها و کلیدواژه‌هاى سه منبع مهم منطق رواقى است که در اختیار علاقه‌مندان این علم قرار گرفته است.

در اهمیت و نقش مهم معجم‌هاى موضوعى در امر پژوهش، یادآورى این مطلب شایسته است که هیچ پژوهش دقیق و فراگیرى، بدون آگاهى از میراث گذشتگان و کارهاى علمى دیگران، شُدنى نیست. به‌ویژه این آگاهى براى نگارش مقاله‌هاى دائرة‌المعارفى كه عهده‌دار گزارشى كامل از تاریخچه و سیر تحولات و بازتاب همه مطالب اصلى درباره یك موضوع‌اند، نیازى جدى است. ولى آگاهى یافتن از میراث گذشتگان، از راه مطالعه كامل آثار بزرگان گذشته و حال، مستلزم صرف زمانى بسیار است كه با توجه به گستردگى اطلاعات و گوناگونى فعالیت‌هاى علمى اندیشمندان، غیرعملى است. ازاین‌رو، «مركز پژوهشى دائرة‌المعارف علوم عقلى اسلامى» كه ازجمله وظایف و اهداف آن، فراهم آوردن زمینه‌هاى پژوهش آسان و سریع است، درصدد برآمد براى برآوردن این هدف راه‌هایى سریع‌تر و آسان‌تر بیابد که از جمله آنها تهیه معجم‌های موضوعی  است.

«مركز پژوهشى دائرة‌المعارف علوم عقلى اسلامى» تاکنون تهیه معجم‌هاى موضوعى را بر روى منابع متعددى از رشته‌هاى گوناگون علوم عقلى انجام داده که دستاورد برخى از این پژوهش‌ها منتشر شده و برخى دیگر در آینده عرضه خواهد شد. 

این بخش از کتاب که «نمایه موضوعى منطق رواقى» عنوان گرفته است، دربردارنده نزدیک به 977 کلیدواژه و 1313 نمایه ترکیبى است. بیشتر کلیدواژه‌ها، کلیدواژه‌هاى اصلى‌اند که نمایه‌ها در ذیل آن‌ها مى‌آیند؛ ولى برخى از کلیدواژه‌ها ارجاعى‌اند. فایده کلیدواژه‌هاى ارجاعى این است که برخى موضوعات، افزون‌بر تعبیر رایج و مرجح با تعبیراتى غیرمرجح نیز به‌کار مى‌روند و ممکن است محققان از راه تعبیرات نامرجح به جست‌وجوى مطلبى بپردازند؛ ازاین‌رو واژه‌هاى نامرجح نیز به‌مثابه کلیدهاى ارجاعى ارائه شده‌اند. نمایه‌هاى این مجموعه تنها دربردارنده نمایه موضوعاتى هستند که در منابع منتخب منطق رواقى به آن‌ها پرداخته شده و از ذکر نمایه سایر بخش‌ها همچون اعلام و آثار چشم‌پوشى شده است.

لوح فشرده همراه

به‌همراه این اثر، لوح فشرده‌ای در اختیار کاربران قرار گرفته که دربردارنده دو نرم‌افزار است:

‌أ) نرم‌افزار اصطلاح‌نامه: این نرم‌افزار دارای امکانات فراوانی است و می‌توان با استفاده از آن، هریک از اصطلاحات و روابط آنها را با دیگر اصطلاحات به‌صورت ساده و پیشرفته جست‌وجو کرد و به نشانی محل درج اصطلاحات و تصویر متن مستندهای آن‌ها دست یافت.

‌ب) نرم‌افزار نمایه موضوعى: این نرم‌افزار، دربردارنده تصویر متن سه منبع مهم منطق رواقى، نمایه‌ها و كلیدواژه‌هاى این منابع است.

این نرم‌افزار داراى امكانات فراوان و قابلیت جست‌وجوهاى ساده و پیشرفته متعددى است که از راه‌هاى مختلف دستیابى به نمایه‌ها و کلیدواژه‌هاى این منابع را ممکن مى‌سازد.